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近日,世和基因在T1+基因测序仪上完成了肿瘤检测产品的适配测试,以技术整合与流程优化为核心,为肿瘤检测领域提供更高效、精准的一体化服务。作为中国肿瘤精准医学的倡行者与4001老百汇官网的长期合作伙伴,世和基因率先成为了T1+的早期用户,加速将“短周期、低成本、高质量”的测序能力落地于肿瘤检测领域,惠及终端患者。
基于同一检测流程的实测数据显示,相较于MGISEQ-2000(简称“2000”)测序平台,T1+能够进一步提升肿瘤基因检测的测序质量(碱基颠换错误率降低42.4%),提升流程效率(全流程缩短30小时,减少70%的手工操作时间),并降低成本(单样本成本降低63%),以卓越的性能表现支撑肿瘤检测向“更准、更快、更普惠”进阶。
测序平台:T1+和2000
样本类型:组织FFPE,血浆
文库类型:探针富集文库
T1+的Q30平均值达96.4%,Q40平均值稳定在91%以上,提供了更高标准的测序质量保障。
T1+单lane的Total Reads平均值达621M,单张FCL总产出达2484M;Total Reads相较于2000平台提升20.4%,且Split Rate(拆分率)仍保持在95%以上,兼顾了高产出效率与数据完整性。

图1:T1+和2000平台下机数据对比
T1+通过“机内集成Make DNB功能”,可直接ssCirDNA上机,省去了手动制备DNB的时间,测序全流程<24h,相较基于2000平台的流程,节省52.5%的时间。

图2:T1+和2000测序时间对比
T1+在碱基颠换(transversion)错误率上显著优化,相较于2000平台,总的单碱基颠换错误率降低了42.4%,意味着碱基序列的准确性得到大幅提升,为后续数据分析的可靠性奠定了更坚实的基础。

图3:T1+和2000平台碱基颠换(transversion)错误率对比
在拷贝数变异(CNV)、结构变异(SV)、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星位点稳定性(MS)四大核心生信分析维度上,T1+也展现出优异的检测性能,与2000平台的检测结果保持了高度的一致性和相关性。这验证了T1+作为Tb级测序平台,在肿瘤基因组变异检测中的准确性与可靠性,可稳定支持肿瘤精准诊疗的生信分析需求。

图4:T1+与2000平台肿瘤基因组变异检测一致性对比
进一步分析测序数据有效reads(Passing Filter (PF) reads)和单核苷酸变异等位基因频率(SNV allele frequency)两个维度,T1+平台表现如下:
T1+在不同Panel和样本类型中,PF reads表现更优、稳定性更强。
无论是FFPE组织样本还是血浆样本,无论小Panel还是大Panel,T1+检测的SNV等位基因频率均呈现高准确性,与2000平台的检测结果保持强线性关联,验证了T1+在单核苷酸变异检测中的高准确性。

图5:T1+与2000平台生信数据表现对比
以PE150测序模式为例,从2000平台升级至T1+可实现“效率、成本、产能、质量”四重跃升:
T1+能在24小时内产出高达1.2Tb测序数据(单载片600Gb,双载片1.2 Tb),同时通过机内集成DNB制备、自动化清洗和生信分析模块,显著优化流程。T1+可缩短30小时全流程时间,并减少70%的手工操作时间,极大地缩减临床检测交付时间,提升实验室运行效率。
一套T1+试剂盒覆盖“环化到测序”全流程,无需额外耗材,相较升级前流程,单样本成本降低63%。
升级至T1+平台后,年数据产量提升2.7倍,节省实验室场地资源的同时,可降低年度维保费用,并减轻实验管理人员的工作压力,优化人力成本,为实验室降本增效提供有力支撑。
T1+搭载全新一代的StandardMPS 2.0测序试剂,实现了所有读长下测序质量均达Q40的突破,T1+的PE150测序模式下,Q40>90%,Q30>93%。

图6:T1+和2000平台全流程对比

原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/MRuIdkh9z6N4NJ2Qqa1-ig
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